تهدف اللجنة التوجيهية لمبادرة آفاق 2020 التي يتناوب على رئاستها (الأردن والاتحاد الأوروبي ممثلًا بالمفوضية الأوروبية) إلى توجيه ومراجعة ورصد وتنسيق النشاطات التي تساهم في التنمية المستدامة بشكل فعال من خلال دمج البعد البيئي في قطاعات أخرى ضمن مستويات مختلفة من الإدارة الحاكمة عبر منطقة البحر الأبيض المتوسط. تتولى اللجنة التوجيهية المسؤولية عن تطبيق مبادرة آفاق 2020. ويشارك أعضاؤها على أساس متساوٍ، وتضم: مؤسسات الاتحاد الأوروبي (المفوضية الأوروبية والمصرف الأوروبي للاستثمار والمنطقة الاقتصادية الأوروبية)، والمناطق الرئيسية للدول الأعضاء في الاتحاد الأوروبي، والمناطق الرئيسية لبلدان البحر الأبيض المتوسط الشريكة في سياسة الجوار الأوروبي، وشركاء آخرون من أصحاب الشأن، مثل المنظمات الحكومية الدولية والمؤسسات المالية الدولية والمنظمات الأهلية والهيئات المحلية والقطاع الخاص وما شابه ذلك. حتى اليوم، عقدت اللجنة التوجيهية ثماني لقاءات (مراكش 2007، تونس 2008، دوبروفنيك 2009، عمان 2011، برشلونة 2012، بروكسل 2013، برشلونة 2014، بروكسل 2016).
لتنفيذ ورصد الخطط، تعالج مجموعات العمل الثلاث:
- الاستثمارات لخفض ومنع التلوث - برئاسة الأمانة العامة للاتحاد من أجل المتوسط والمصرف الأوروبي للاستثمار.
- بناء القدرات لتحقيق أهداف مبادرة آفاق 2020 - برئاسة الأمانة العامة للاتحاد من أجل المتوسط، حيث يتناوب على الرئاسة (الأردن والاتحاد الأوروبي ممثلًا بالمفوضية الأوروبية) وبرنامج الأمم المتحدة للبيئة / خطة عمل البحر الأبيض المتوسط.
- المراجعة والرصد - برئاسة الوكالة الأوروبية للبيئة وبرنامج الأمم المتحدة للبيئة / خطة عمل البحر الأبيض المتوسط.
يوجد أيضًا مكون بحثي لتسهيل تدفق النتائج المرتبطة من مشاريع بحثية لمبادرة آفاق 2020 (حوض البحر الأبيض المتوسط) والمديرية العامة للأبحاث وبرنامج تمويل مبادرة آفاق 2020 للابتكار.