Suite au lancement de l'Union pour la Méditerranée, la portée géographique d'Horizon 2020 s'est étendue de manière à inclure les points focaux d'Albanie, de Bosnie-Herzégovine, de Croatie (qui n'était pas encore membre de l'UE) et du Monténégro. Mettant à profit les instruments politiques de l'UE, H2020 coopère et s'efforce de se coordonner et de se mettre en synergie avec les autres programmes compétents.
Pendant la période 2009-2014, l'Union européenne a financé un projet de chaque composante, en plus des autres sources, tout particulièrement :
- Le Programme d'Investissement Points chauds en Méditerranée - Préparation du projet et Facilité de mise en œuvre (MeHSIP-PPIF) - Investissements pour la Réduction et la Prévention de la Pollution (PRPI) ;
- Le Programme H2020 de Renforcement des capacités/ Programme méditerranéen pour l'environnement (H2020 CB/MEP) - Renforcement des capacités (CB). Dans le cadre de ce projet, et en plus des activités visant le renforcement des capacités s'attaquant aux problèmes de pollution aux niveaux institutionnel et sociétal, une étude sur les investissements dans les points chauds pour les Balkans occidentaux et la Turquie (WeB&THSiS) a été menée, en complément du MeHSIP.
- L'instrument de politique européenne de Voisinage - Système de partage d'informations sur l'environnement (PEV-SEIS) - Examen et surveillance (RM).
L'Union européenne finance à l'heure actuelle la deuxième phase :
- du Programme d'Investissement Points chauds en Méditerranée (MeHSIP) - composante H2020 PRPI ;
- de la suite de CB/MEP à l'aide du Mécanisme de Soutien Horizon 2020 (2016-2019), qui fait partie du Programme sur la gestion intégrée durable de l'eau, financé par l'Union européenne - Projet Mécanisme de Soutien de I'Initiative Horizon 2020 (SWIM-Horizon2020 SM) ;
- et du Mécanisme de Soutien Système de partage d'informations sur l'environnement (SEIS) - composante H2020 RM.
